À l'Académie Kadic, Aelita est visité par son père et a prévenu une attaque. Le lendemain, des monstres de X.A.N.A. Ont envahi la région en attaquant tout le monde et tout le monde. Maintenant, les Warriors Lyoko sont attaqués par un nouvel ennemi qui a la capacité de prendre le contrôle des guerriers. Soyez avec ces guerriers, aidez-les!